Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG1

PRTFDC1, Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTFDC1Q9NRG1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRTFDC1Q9NRG1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRTFDC1Q9NRG1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRTFDC1Q9NRG1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTFDC1Q9NRG1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTFDC1Q9NRG1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTFDC1Q9NRG1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTFDC1Q9NRG1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTFDC1Q9NRG1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTFDC1Q9NRG1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTFDC1Q9NRG1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTFDC1Q9NRG1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRTFDC1Q9NRG1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRTFDC1Q9NRG1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRTFDC1Q9NRG1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms