Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRIP3Q9NQ35 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRIP3Q9NQ35 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms