Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

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Length 1,180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A2Q9NQ11 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A2Q9NQ11 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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