Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF12AQ9NP84 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms