Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
XAB2Q9HCS7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms