Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC4Q9HBW1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms