Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF2Q9HAU4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms