Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB17Q9H0T7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB17Q9H0T7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB17Q9H0T7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB17Q9H0T7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB17Q9H0T7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB17Q9H0T7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB17Q9H0T7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB17Q9H0T7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB17Q9H0T7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms