Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMBRA1Q9C0C7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms