Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPEF2Q9C093 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPEF2Q9C093 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPEF2Q9C093 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPEF2Q9C093 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPEF2Q9C093 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPEF2Q9C093 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPEF2Q9C093 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SPEF2Q9C093 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPEF2Q9C093 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPEF2Q9C093 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPEF2Q9C093 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPEF2Q9C093 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms