Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT23Q9C075 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT23Q9C075 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms