Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM6SF2Q9BZW4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM6SF2Q9BZW4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms