Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDEM3Q9BZQ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDEM3Q9BZQ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms