Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RSPO3Q9BXY4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms