Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
JAM3Q9BX67 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JAM3Q9BX67 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JAM3Q9BX67 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JAM3Q9BX67 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JAM3Q9BX67 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JAM3Q9BX67 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JAM3Q9BX67 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JAM3Q9BX67 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
JAM3Q9BX67 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JAM3Q9BX67 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JAM3Q9BX67 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JAM3Q9BX67 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms