Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF7Q9BWX1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms