Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW5

TIPIN, TIMELESS-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPINQ9BVW5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TIPINQ9BVW5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIPINQ9BVW5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms