Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM62Q9BVG3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM62Q9BVG3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM62Q9BVG3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM62Q9BVG3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM62Q9BVG3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM62Q9BVG3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM62Q9BVG3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms