Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB2BQ9BVA1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms