Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPPD1Q9BV87 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms