Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3Q9BV44 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
THUMPD3Q9BV44 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms