Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf16Q9BUW7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf16Q9BUW7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms