Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSRP1Q9BUV0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSRP1Q9BUV0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms