Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms