Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C2orf88Q9BSF0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms