Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF559Q9BR84 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF559Q9BR84 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms