Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPIN3Q9BQK8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPIN3Q9BQK8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPIN3Q9BQK8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms