Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC1Q99614 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms