Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP4Q99569 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms