Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SORT1Q99523 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORT1Q99523 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms