Protein–RNA interactions for Protein: Q96SI9

STRBP, Spermatid perinuclear RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRBPQ96SI9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRBPQ96SI9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRBPQ96SI9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STRBPQ96SI9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms