Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ALS2Q96Q42 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ALS2Q96Q42 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ALS2Q96Q42 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ALS2Q96Q42 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ALS2Q96Q42 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms