Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD27Q96NW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD27Q96NW4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD27Q96NW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD27Q96NW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD27Q96NW4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD27Q96NW4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD27Q96NW4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD27Q96NW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD27Q96NW4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD27Q96NW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD27Q96NW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD27Q96NW4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ANKRD27Q96NW4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD27Q96NW4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms