Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH12Q96NR8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH12Q96NR8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH12Q96NR8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms