Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE2Q96MF7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE2Q96MF7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE2Q96MF7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms