Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00477Q96M19 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00477Q96M19 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms