Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF354BQ96LW1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF354BQ96LW1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF354BQ96LW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms