Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM47Q96LD4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM47Q96LD4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms