Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIC2Q96JB3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIC2Q96JB3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms