Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNF8Q96H20 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNF8Q96H20 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms