Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFT43Q96FT9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms