Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUB2Q96DC9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms