Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC58Q96CX6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms