Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP3Q96CW5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP3Q96CW5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms