Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms