Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRN2Q92932 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRN2Q92932 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms