Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDAQ92838 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDAQ92838 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDAQ92838 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDAQ92838 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDAQ92838 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EDAQ92838 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDAQ92838 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDAQ92838 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDAQ92838 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDAQ92838 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDAQ92838 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDAQ92838 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDAQ92838 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDAQ92838 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDAQ92838 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDAQ92838 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDAQ92838 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EDAQ92838 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDAQ92838 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EDAQ92838 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EDAQ92838 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDAQ92838 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDAQ92838 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDAQ92838 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDAQ92838 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDAQ92838 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDAQ92838 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDAQ92838 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDAQ92838 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDAQ92838 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDAQ92838 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EDAQ92838 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDAQ92838 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDAQ92838 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDAQ92838 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDAQ92838 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDAQ92838 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDAQ92838 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDAQ92838 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDAQ92838 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDAQ92838 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EDAQ92838 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDAQ92838 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EDAQ92838 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDAQ92838 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDAQ92838 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDAQ92838 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDAQ92838 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDAQ92838 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDAQ92838 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDAQ92838 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDAQ92838 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDAQ92838 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDAQ92838 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EDAQ92838 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDAQ92838 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDAQ92838 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDAQ92838 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDAQ92838 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDAQ92838 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EDAQ92838 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDAQ92838 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EDAQ92838 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDAQ92838 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDAQ92838 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDAQ92838 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDAQ92838 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDAQ92838 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDAQ92838 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDAQ92838 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDAQ92838 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDAQ92838 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDAQ92838 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDAQ92838 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDAQ92838 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDAQ92838 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDAQ92838 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDAQ92838 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDAQ92838 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDAQ92838 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDAQ92838 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDAQ92838 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDAQ92838 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDAQ92838 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDAQ92838 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDAQ92838 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDAQ92838 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDAQ92838 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDAQ92838 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDAQ92838 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDAQ92838 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDAQ92838 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDAQ92838 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDAQ92838 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDAQ92838 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EDAQ92838 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDAQ92838 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDAQ92838 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDAQ92838 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms