Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC9Q92623 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC9Q92623 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms