Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG1Q8WTW3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms