Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms